看点：位于东京西部的巨大“学园都市”，实施超能力开发特殊课程，学生们的能力被评价为六阶段，高中生上条当麻隐藏着独特力量。暑假开始时，一位纯白修女的出现将上条的生活彻底改变。与来自“魔法”世界的禁书目录茵蒂克丝相遇后，上条被卷入一系列事件中。在解决科学与魔法方的事件过程中，上条的人际关系也逐渐扩展。随着罗马正教十字教派的注意，上条的存在引起了更多关注。科学方和魔法方在学园都市内的各自动作逐渐显现，引发更多故事发展。

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